ОрбиСИМС. Фото: Университет Ноттингема 7SK — это человеческая РНК, связанная с ВИЧ-инфекцией. Мы исследовали это в качестве примера для статьи. Фото: Ноттингемский университет.
Ученые из Ноттингемского университета разработали метод анализа структуры молекул РНК на атомном уровне с исключительной точностью и скоростью и первыми в мире используют этот метод для изучения структурных изменений в РНК при заражении клетки ВИЧ. .
Выводыкоторые опубликованы в Природные коммуникацииможет иметь далеко идущие последствия для лечения различных заболеваний, в которых РНК играет решающую роль, а также для разработки терапевтических средств, таких как мРНК-вакцины.
РНК, близкая родственница ДНК, играет решающую роль в различных биологических процессах, от синтеза белка до регуляции генов. Однако, в отличие от хорошо известной структуры двойной спирали ДНК, РНК сворачивается в сложные формы, которые невероятно сложно проанализировать с помощью традиционных методов.
Именно здесь команда Ноттингема во главе с доктором Адити Боркаром, доцентом кафедры молекулярной биохимии и биофизики Школы ветеринарной медицины и науки, совершила революционный подвиг.
Доктор Боркар разработал мощный метод, который сочетает в себе передовую технологию масс-спектрометрии под названием криогенная OrbiSIMS — уникальные возможности университета в области визуализации — с передовым компьютерным моделированием и автоматизацией. Эта комбинация позволила команде за считанные дни проанализировать аттомольные количества РНК и определить их трехмерные структуры на уровне отраслевых стандартов.
Этот инновационный подход обещает значительный прогресс в сфере охвата, точности и скорости структурной биологии РНК и ускорит разработку терапии на основе РНК.
Доктор Боркар сказал: «РНК — одна из самых сложных молекул для изучения с помощью структурной биологии. OrbiSIMS как минимум в 1000 раз более чувствителен для изучения РНК по сравнению с другими структурными методами, обычно используемыми в нашей области.
«Благодаря нашему управляемому конвейеру OrbiSIMS мы теперь можем определять структуры РНК за считанные дни, а не за месяцы. Эта невероятная чувствительность и скорость теперь помогут нам изучать ранее трудноразрешимые цели в узкие сроки разработки лекарств».
Прибор OrbiSIMS был разработан в Национальной физической лаборатории Великобритании при консультации с GSK. Ноттингем был первым университетом в мире, который владел и использовал прибор OrbiSIMS.
Предоставлено Ноттингемским университетом